Taller de secuenciación genómica y análisis bioinformático para virus Dengue
Del 9 al 13 de octubre del 2023, Tegucigalpa, Honduras
Laboratorio Nacional de Referencia, Ministerio de Salud
Antecedentes
En 2014, la OPS junto con el CDC y RELDA (Red de Laboratorios de Arbovirus de las Américas) lanzaron el proyecto ViGenDA (vigilancia genómica del virus dengue en América) con el objetivo de caracterizar los virus del dengue circulantes en la región de las Américas y a partir de esta información, establecer una vigilancia genómica del dengue de manera sistemática, a través de los sistemas de vigilancia integrados y los laboratorios de la RELDA.
Se desarrollaron e implementaron herramientas para la vigilancia epidemiológica molecular de los genotipos de dengue en las Américas. Según el contexto epidemiológico actual de las arbovirosis en la región, desde 2018, ViGendA fue expandida como una plataforma de vigilancia genómica de Arbovirus, incorporando además de dengue, también Chikungunya y Zika.
Objetivos
- Revisar la metodología del laboratorio para el procesamiento de muestras y construcción de librerías genómicas y secuenciación de nueva generación para el virus dengue.
- Capacitar sobre el proceso de análisis de datos de secuenciación para extraer secuencias finales e información filogenética como genotipos y linajes.
- Discutir sobre plataformas customizadas de análisis, pipelines bioinformáticos y la Integración de datos genómicos a la vigilancia epidemiológica de Arbovirus.