La resistencia a los antimicrobianos (RAM) en bacterias asociadas con la producción animal y los alimentos representa una preocupación creciente para la salud pública en las Américas y el Caribe. La circulación de bacterias resistentes y de genes de resistencia a lo largo de la cadena alimentaria puede contribuir a la diseminación de determinantes de importancia clínica, lo que refuerza la necesidad de una vigilancia integrada bajo el enfoque de Una Sola Salud. Aunque la producción científica regional ha avanzado, persisten diferencias importantes en la capacidad de vigilancia entre los países, con una concentración de estudios en determinados territorios y escasez de datos comparables en parte de América Central y el Caribe.

Entre los agentes prioritarios, Salmonella spp. y Escherichia coli merecen especial atención debido a la emergencia de resistencia a cefalosporinas de tercera generación, mediada por β-lactamasas de espectro extendido (BLEE), resistencia a la colistina asociada a genes mcr y, más recientemente, a la identificación de enterobacterias productoras de carbapenemasas en animales, alimentos y ambientes relacionados con la producción.

Según la Lista de Patógenos Bacterianos Prioritarios de la OMS de 2024 (WHO Bacterial Priority Pathogens List, BPPL 2024), los microorganismos resistentes pertenecientes al orden Enterobacterales ocupan la categoría de prioridad crítica, particularmente aquellos resistentes a cefalosporinas de tercera generación y a carbapenémicos. 

Es importante precisar que Salmonella spp. y Escherichia coli pertenecen al orden Enterobacterales, pero la BPPL 2024 las sitúa en categorías específicas según la combinación de patógeno y resistencia evaluada. En particular, Salmonella no tifoidea resistente a fluoroquinolonas está clasificada como de alta prioridad, debido al aumento de la resistencia a los tratamientos disponibles y a la elevada carga de enfermedad asociada, especialmente en países de ingresos bajos y medianos.

La OMS también destaca que esta priorización debe adaptarse a las características epidemiológicas y ecológicas de cada región. En este contexto, para las Américas y el Caribe resulta particularmente importante ampliar la vigilancia de E. coli y Salmonella de origen animal y alimentario, con especial atención a los mecanismos de resistencia a cefalosporinas de tercera generación (BLEE y AmpC), carbapenemasas y resistencia a colistina mediada por genes mcr. 

La resistencia a la colistina mediada por mcr-1 también constituye una preocupación relevante debido a la localización de este gen en elementos genéticos móviles y a su potencial de diseminación horizontal. Estudios realizados en el continente documentaron su presencia en diferentes fuentes, incluidos animales, alimentos y muestras ambientales. 

Paralelamente, los informes sobre carbapenemasas, incluidos los genes blaNDM, blaKPC y blaOXA-48-like, en bacterias de origen animal y alimentario refuerzan la necesidad de una investigación sistemática. Sin embargo, la evidencia disponible para estos mecanismos es desigual: su detección en algunos aislamientos no debe interpretarse como una diseminación generalizada en toda la región.

En Campylobacter jejuni y C. coli, asociados principalmente con la producción avícola y la carne de aves, la resistencia a las fluoroquinolonas está ampliamente documentada en los estudios sudamericanos, mientras que la resistencia a los macrólidos, especialmente a la eritromicina, representa una preocupación clínica importante. Otro mecanismo de interés es el gen cfr(C), identificado en Campylobacter de origen animal y alimentario. Este gen se ha asociado con multirresistencia, conferindo resistencia a varias clases de antimicrobianos. La investigación conjunta de cfr(C), de los mecanismos específicos de resistencia a los macrólidos y de los contextos genéticos móviles es importante para comprender el potencial de diseminación de estos determinantes. Aunque los estudios genómicos han demostrado la distribución de cfr(C), con evidencia genómica en las Américas, y su asociación con diferentes linajes de C. coli, la magnitud de su presencia en animales y alimentos en las Américas y el Caribe aún debe establecerse con mayor precisión.

Actualmente, existe una creciente evidencia genómica sobre la diversidad de los mecanismos de resistencia, la diseminación de linajes bacterianos y la circulación de genes mediante plásmidos y otros elementos genéticos móviles. La secuenciación del genoma completo (WGS), asociada con el análisis del resistoma, la tipificación molecular y la caracterización de plásmidos, permite investigar las relaciones entre aislamientos de animales, alimentos, seres humanos y ambiente. Estas herramientas son fundamentales para distinguir la diseminación clonal de la transferencia horizontal de genes e identificar mecanismos emergentes antes de que se establezcan ampliamente.

Las redes regionales de vigilancia genómica coordinadas por la OPS, en el marco de PAHOGen, ofrecen una plataforma para fortalecer las capacidades de secuenciación, bioinformática, intercambio de información e integración de datos genómicos con la vigilancia epidemiológica. Entre las redes que forman parte de este marco se encuentran PulseNet y ReLAVRA+, relevantes para la vigilancia de patógenos transmitidos por alimentos y de la resistencia a los antimicrobianos, respectivamente.

Ante este escenario, las prioridades para las Américas y el Caribe deben incluir el fortalecimiento de la vigilancia fenotípica y genómica de Salmonella, E. coli y Campylobacter; la investigación dirigida de BLEE, AmpC, carbapenemasas y genes mcr en Salmonella y E. coli; y el monitoreo de la resistencia a las fluoroquinolonas, a los macrólidos y de cfr(C) en Campylobacter spp.. La armonización de los métodos de laboratorio, el intercambio de datos entre países y la ampliación de la vigilancia en territorios insuficientemente representados son esenciales para comprender la distribución regional de la RAM y orientar intervenciones basadas en la evidencia.

La resistencia antimicrobiana en animales y alimentos debe abordarse como un problema regional y multisectorial. La integración de datos fenotípicos, genómicos y epidemiológicos, articulada con la cooperación entre los sectores de salud humana, sanidad animal, agricultura y ambiente, constituye una estrategia central para detectar mecanismos emergentes, comprender sus vías de diseminación y fortalecer la inocuidad de los alimentos en las Américas y el Caribe.