A Rede
A estrutura da rede inclui uma combinação de países com capacidade de sequenciamento interno e aqueles que enviam para sequenciamento externo a um dos dois Laboratórios Regionais de Sequenciamento (Fundação Oswaldo Cruz/FIOCRUZ - Brasil e Instituto de Saúde Pública/ISPCH-Chile). Além disso, treinamentos regionais e nacionais e ações adicionais de suporte para gerar informações oportunas sobre dados de sequenciamento genômico do SARS-CoV-2 estão disponíveis por meio da rede.
COV|GEN
Rede Regional de Vigilância Genômica de COVID-19
A OPAS incentiva os laboratórios a sequenciar amostras positivas de COVID-19 e compartilhar informações genéticas oportunamente através da plataforma GISAID (do inglês, Global Initiative on Sharing All Influenza Data).
A participação na Rede Regional de Vigilância Genômica COVID-19 é aberta a todos os países das Américas por meio dos Laboratórios Nacionais de Saúde Pública. Para mais informações, entre em contato com o Escritório Regional da OPAS por e-mail leitejul@paho.org, ricoj@paho.org.
Laboratórios de Sequenciamento Genômico de SARS-CoV-2
© Organização Pan-Americana da Saúde, 2020. Todos os direitos reservados.
Produção de relatórios: Departamento de Emergências de Saúde da OPAS (PHE): Equipe de Vigilância da Influenza / Gestão de Riscos Infecciosos (IHM) e Gestão de Dados, Análise e Produtos / Informações sobre Emergências de Saúde e Avaliações de Riscos (HIM).
Isenção de responsabilidade: As designações utilizadas e a apresentação do material nestes mapas não implicam a expressão de qualquer opinião por parte da Secretaria da Organização Pan-Americana da Saúde sobre a situação jurídica de qualquer país, território, cidade ou zona ou de suas autoridades. , ou na delimitação de suas fronteiras ou limites. As linhas pontilhadas e tracejadas nos mapas representam as linhas de fronteira aproximadas para as quais pode não haver acordo total.
Variantes de SARS-CoV-2 nas Américas
Desde a caracterização genômica inicial do SARS-CoV-2, o vírus evoluiu em diferentes grupos genéticos. A ocorrência de mutações é um evento natural e esperado dentro do processo de evolução do vírus.
- Mutação refere-se a qualquer mudança no genoma viral.
- Algumas mutações específicas definem os grupos genéticos virais que circulam atualmente mundialmente.
- Em geral, Um vírus mutado é chamado de variante do vírus original.
- Existem diferentes tipos de mutações. As variantes podem diferir em uma ou mais delas.
- Apesar da maiorai das mutações não ter nenhum impacto, algumas podem fazer com que o vírus seja mais transmissível, ou facilitar o escape do vuris da resposta imune.
- Na comunidade, quanto mais elevado é o nível de transmissão, maior é a probabilidade de que ocorra mutações no virus.
Quando essas variantes têm um potencial impacto ou risco para a saúde pública, elas são consideradas variantes de preocupação (VOC, do inglês Variant of Concern)
Classificação de Variantes1
Um isolado de SARS-CoV-2 é uma variante de interesse (VOI) se muda fenotipicamente em comparação com um isolado de referência ou tiver um genoma com mutações que levem a alterações de aminoácidos associadas a implicações fenotípicas estabelecidas ou suspeitas;
E
foi identificado que causar transmissão comunitária/múltiplos casos/clusters COVID-19, ou foi detectado em vários países;
OU
foi avaliado como uma VOI pela OMS em consulta com o Grupo de Trabalho de Evolução do Vírus SARS-CoV-2 da OMS.
Uma VOI é uma variante de preocupação (VOC) se, através de uma avaliação comparativa, tiver demostrado que está associada a
- Aumento da transmissibilidade ou alteração prejudicial na epidemiologia da COVID-19;
- Aumento da virulência ou mudança na apresentação clínica da doeça; ou
- Diminuição da eficácia das medidas sociais e de saúde pública ou do diagnósticos, vacinas, terapias disponíveis.
OU
foi avaliado como uma VOC pela OMS em consulta ao Grupo de Trabalho de Evolução do Vírus SARS-CoV-2 da OMS
1https://www.who.int/publications/m/item/covid-19-weekly-epidemiological-update
GISAID - Sistema de rastreamento de variantes
Monitoramento de variantes SARS-CoV-2
Mutações ou variantes virais estão sendo monitoradas desde o início da pandemia da COVID-19 através do banco de dados de sequencia GISAID (do inglês, Global Initiative on Sharing Avian Influenza Data). A OMS avalia rotineiramente se as variantes de SARSCoV-2 têm impacto sobre:
- Transmissibilidade do vírus
- Gravidade da doença
- Efetividade de diagnósticos, terapias e vacinas
- Avaliação de risco das variantes de preocupação para determinar se haverá implicações para a saúde pública é realizada rotineiramente.
Principais ações de um Estado-Membro, se uma VOI ou VOC for identificada:
- Reportar imediatamente à OPAS/OMS casos/conglomerados iniciais associados à infecção por VOI ou VOC através do mecanismo do Regulamento Sanitário Internacional (RSI).
- Enviar sequências completas do genoma e metadados associados a um banco de dados disponível publicamente, como o GISAID.
- Quando existir capacidade e em coordenação com a comunidade internacional, realizar investigações de campo para melhorar a compreensão dos potenciais impactos do VOI ou VOC na epidemiologia COVID-19, gravidade, eficácia da saúde pública e medidas sociais, ou outras características relevantes.
- Realizar avaliações laboratoriais ou entrar em contato com a OPAS para obter suporte para realizar avaliações laboratoriais sobre o impacto da VOI ou VOC em métodos de diagnósticos, respostas imunes, neutralização de anticorpos ou outras características relevantes.