Les Organes directeurs comprennent la Conférence sanitaire panaméricaine, le Conseil directeur et le Comité exécutif. L'organe consultatif auxiliaire du Comité exécutif est le Sous-comité du programme, du budget et de l'administration.
Organes directeurs
Conférence sanitaire panaméricaine
La Conférence sanitaire panaméricaine est l'autorité suprême qui régit l'Organisation. Elle se réunit tous les 5 ans pour élire le Directeur de l’OPS et déterminer sa politique générale.
Conseil directeur
Le Conseil directeur agit au nom de la Conférence sanitaire panaméricaine et se réunit une fois par an lors des années où cette dernière ne se réunit pas.
Comité exécutif
Le Comité exécutif est composé de 9 États Membres, élus par la Conférence ou le Conseil, pour des périodes de 3 ans qui se chevauchent. Le Comité exécutif se réunit deux fois par an et fonctionne comme un comité de la Conférence ou du Conseil.
Sous-comité du programme, du budget et de l'administration
Le Sous-comité du programme, du budget et de l'administration est un organe consultatif auxiliaire du Comité exécutif qui est composé de 7 États Membres. Le Sous-comité tient au moins une session par an et fait des recommandations au Comité exécutif.